يتولى اتحاد الجمارك الرياضي المهام والواجبات التالية :
– أولا : نشر الرياضة بليبيا .
– ثانيا : الالتزام بالفلسفة العامة لمصلحة الجمارك التي تعمل علي رعاية منتسبيها رعاية متكاملة تؤهلهم لأداء دورهم الطليعي والإيجابي لخدمة مجتمعهم .
– ثالثا : العمل بالتعاون مع المصالح والهيئات والإدارات العامة والمديريات الجمركية على تشجيع الأنشطة والألعاب الرياضية بمختلف أنواعها ونشرها بين منتسبي مصلحة الجمارك وذلك عن طريق مزاولة الأنشطة الرياضية التي تلائم وقدرات كل عضو للارتقاء بمستوي اللياقة البدنية الصحية لكل واحد منهم .
– رابعا : رسم الخطط وأعداد البرامج والأشراف علي الألعاب والأنشطة المختلفة وإقامة المسابقات بين منتسبي قطاع الجمارك وذلك للارتقاء بمستوي المهارات وصولا إلي إعداد فرق رياضية لإفراز اللاعبين الموهوبين لاختيارهم بالمنتخبات التي ستشارك في المنافسات والمسابقات محليا وعربيا ودوليا.
– خامسا : إعداد الدورات التدريبية الرياضية والأشراف عليها .
– سادساً : المشاركة في الاجتماعات والمؤتمرات واللقاءات التي تجريها المنظمات المماثلة العربية والدولية بالشكل الذي يكفل لهذا القطاع إثبات وجوده الفعال في هذه المحافل وظهوره بالمظهر المشرف .
– سابعاً : المشاركة في المناشط الرياضية التي تشرف عليها الهيئات والمؤسسات والاتحادات العامة والتي تهدف إلي نشر الرياضة وتعميمها وافراز الموهوبين .
– ثامناً : المشاركة في المسابقات العربية والقارية والدولية .
– تاسعاً : تنظيم التظاهرات الرياضية بالاشتراك مع المؤسسات التعليمية والأندية الأخرى بنطاق المنطقة التي يقع في نطاقها الاتحاد أو أحد فروعه .
– عاشرا : إقامة اللقاءات في كافة الألعاب مع فرق خارجية أو محلية .
– الحادي عشر : تنظيم الزيارات والرحلات والبرامج الترفيهية التي تقوي الروابط الاجتماعية بين منتسبي مصلحة الجمارك .
– الثاني عشر : تنظيم وتوثيق العلاقات الرياضية مع اتحادات الجمارك الرياضية في الدول العربية ودول الاتحاد المغاربي والدول الصديقة .
– الثالث عشر : الإعداد والمشاركة في النشاطات الترفيهية والثقافية وإصدار النشرات والصحف الحائطية .
– الرابع عشر :  إعداد برامج رياضية وترفيهية وتعليمية للأطفال من أبناء أعضاء مصلحة الجمارك أو أبناء المواطنين الذين يقيمون بالمنطقة التي يقع في نطاقها الاتحاد أو أحد فروعه .